2路[上行]： 墨香路总站 -- 樱铁村 -- 玄武大道·长途东站 -- 新庄广场东 -- 新庄广场南 -- 锁金村 -- 龙蟠路·岗子村 -- 太平门 -- 北京东路·九华山 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 网巾市 -- 青石街 -- 羊皮巷 -- 内桥 -- 内桥南 -- 中华路·三山街 -- 中华路·瞻园路 -- 中华门城堡 -- 大报恩寺遗址公园 -- 中华门地铁站

2路[下行]： 中华门地铁站 -- 应天大街·雨花路 -- 大报恩寺遗址公园 -- 中华门城堡 -- 中华路·长乐路 -- 中华路·瞻园路 -- 中华路·三山街 -- 内桥南 -- 内桥 -- 羊皮巷 -- 新街口·正洪街 -- 青石街 -- 网巾市 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 北京东路·兰园 -- 北京东路·九华山 -- 太平门 -- 龙蟠路·岗子村 -- 锁金村 -- 新庄广场南 -- 玄武大道·长途东站 -- 樱铁村 -- 墨香路总站

31路[上行]： 中山码头 -- 盐仓桥广场西 -- 中山北路·萨家湾 -- 中山北路·三牌楼 -- 中山北路·虹桥 -- 中山北路·大方巷 -- 中山北路·鼓楼 -- 北京东路·进香河路 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 南京图书馆 -- 大行宫南 -- 杨公井 -- 太平南路·常府街 -- 太平南路·白下路 -- 建康路

31路[下行]： 建康路 -- 白下路·大中桥 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·常府街 -- 杨公井 -- 南京图书馆 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 北京东路·进香河路 -- 北京东路·鼓楼 -- 中山北路·鼓楼 -- 中山北路·大方巷 -- 山西路 -- 中山北路·虹桥 -- 中山北路·三牌楼 -- 中山北路·萨家湾 -- 南医大二附院东院 -- 盐仓桥广场西 -- 中山码头

304路[上行]： 雨花台南大门 -- 雨花新村 -- 共青团路·普德村 -- 雨花台北大门 -- 雨花路立交桥 -- 雨花台东大门 -- 养回红村 -- 卡子门西 -- 城头城 -- 路子铺 -- 秦虹桥 -- 白鹭东苑 -- 七里街 -- 建康路·大中桥 -- 长白街 -- 太平巷 -- 常府街北 -- 科巷 -- 总统府 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 鸡鸣寺 -- 玄武湖公园 -- 西家大塘

304路[下行]： 西家大塘 -- 玄武湖公园 -- 鸡鸣寺 -- 成贤街·东南大学 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 总统府 -- 科巷 -- 常府街北 -- 太平巷 -- 长白街 -- 建康路·大中桥 -- 七里街 -- 白鹭东苑 -- 秦虹桥 -- 路子铺 -- 城头城 -- 卡子门西 -- 养回红村 -- 雨花台东大门 -- 雨花路立交桥 -- 雨花台北大门 -- 共青团路·普德村 -- 雨花新村 -- 雨花台南大门

3路环线[上行]： 随家仓 -- 南阴阳营 -- 山阴路 -- 西康路 -- 玉泉路 -- 莫干路 -- 江苏路 -- 傅佐路 -- 湖南路 -- 中央路·鼓楼 -- 北京东路·进香河路 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 南京图书馆 -- 新街口东 -- 新街口西 -- 大锏银巷 -- 五台山 -- 永庆巷 -- 拉萨路 -- 脑科医院

3路环线[下行]： 随家仓 -- 脑科医院 -- 拉萨路 -- 永庆巷 -- 五台山 -- 大锏银巷 -- 新街口西 -- 新街口东 -- 南京图书馆 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 北京东路·鼓楼 -- 中央路·鼓楼 -- 湖南路 -- 傅佐路 -- 江苏路 -- 莫干路 -- 玉泉路 -- 西康路 -- 山阴路 -- 南阴阳营

44路[上行]： 宁双路东上客 -- 宁双路东 -- 宁双路 -- 唐家洼 -- 共青广场 -- 尹家巷北 -- 南北中村 -- 花神大道 -- 望江矶 -- 公交总公司驾校 -- 雨花南路·安德门 -- 能仁里 -- 雨花西路 -- 窑湾街 -- 钓鱼台 -- 中华路·瞻园路 -- 中华路·三山街 -- 内桥南 -- 长白街 -- 太平巷 -- 常府街北 -- 科巷 -- 总统府 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 兰园

44路[下行]： 兰园 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 总统府 -- 科巷 -- 常府街北 -- 太平巷 -- 白下路 -- 内桥南 -- 中华路·三山街 -- 中华路·瞻园路 -- 钓鱼台 -- 窑湾街 -- 雨花西路 -- 能仁里 -- 雨花南路·安德门 -- 公交总公司驾校 -- 望江矶 -- 花神大道 -- 南北中村 -- 尹家巷北 -- 共青广场 -- 唐家洼 -- 宁双路 -- 宁双路东

52路[上行]： 银城东苑 -- 东苑北 -- 钟山花园城 -- 后标营路·童卫路 -- 富丽山庄北 -- 苜蓿园大街 -- 小天堂 -- 苜蓿园大街南 -- 石门坎 -- 石门坎西 -- 光华路西 -- 光华门北 -- 标营 -- 瑞金路 -- 瑞金北村 -- 黄埔路 -- 黄埔路·马标 -- 珠江路·小营 -- 浮桥 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 北京东路·鼓楼 -- 中山北路·鼓楼 -- 中山北路·大方巷 -- 湖北路南

52路[下行]： 湖北路南 -- 中山北路·鼓楼 -- 北京东路·进香河路 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 四牌楼 -- 浮桥 -- 珠江路·小营 -- 马标 -- 黄埔路 -- 瑞金北村 -- 瑞金路 -- 标营 -- 光华门北 -- 光华路西 -- 石门坎西 -- 石门坎 -- 天堂村 -- 苜蓿园大街南 -- 小天堂 -- 苜蓿园大街 -- 富丽山庄北 -- 后标营路·童卫路 -- 钟山花园城 -- 东苑北 -- 银城东苑

95路[上行]： 南堡公园西 -- 金陵六村 -- 燕江路 -- 金陵小区 -- 金陵村 -- 金燕路南 -- 水关桥 -- 水关桥西 -- 晓街 -- 金海市场 -- 民生街 -- 钟阜路·城河村 -- 黑龙江路西 -- 南瑞路·紫竹林 -- 东柏果园 -- 司背后街 -- 市青少年宫 -- 湖北路 -- 湖北路南 -- 中山北路·鼓楼 -- 丹凤街 -- 大石桥 -- 东南大学 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 大行宫东 -- 总统府

B13路[上行]： 北京东路·兰园 -- 北京东路·九华山 -- 太平门南 -- 龙蟠中路·荷包套 -- 龙蟠中路·小营 -- 珠江路·小营 -- 浮桥 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺

B13路[下行]： 北京东路·兰园 -- 北京东路·九华山 -- 太平门南 -- 龙蟠中路·荷包套 -- 龙蟠中路·小营 -- 珠江路·小营 -- 浮桥 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺

Y2路[上行]： 幕府创新小镇 -- 幕府东路 -- 晓庄村 -- 南京卫校 -- 晓庄 -- 和燕路·青城路 -- 南砖新村 -- 和燕路·迈皋桥 -- 东井村 -- 红山站 -- 东井亭 -- 安怀村东 -- 安怀村 -- 中央门北 -- 中央门南 -- 许府巷 -- 玄武湖隧道 -- 玄武湖公园 -- 玄武门地铁站南 -- 中央路·鼓楼 -- 北京东路·进香河路 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 四牌楼 -- 大行宫北 -- 南京图书馆 -- 大行宫南 -- 杨公井 -- 太平南路·常府街 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·夫子庙 -- 中华路·瞻园路 -- 中华门城堡 -- 大报恩寺遗址公园 -- 应天大街·雨花路

Y2路[下行]： 应天大街·雨花路 -- 大报恩寺遗址公园 -- 中华门城堡 -- 中华路·长乐路 -- 中华路·瞻园路 -- 太平南路·夫子庙 -- 四象桥 -- 太平南路·白下路 -- 太平南路·常府街 -- 杨公井 -- 大行宫南 -- 南京图书馆 -- 大行宫北 -- 四牌楼 -- 太平北路·鸡鸣寺 -- 市口腔医院 -- 玄武门地铁站南 -- 观音里 -- 玄武湖隧道 -- 中央门南 -- 中央门北 -- 安怀村 -- 安怀村东 -- 东井亭 -- 红山站 -- 东井村 -- 和燕路·迈皋桥 -- 迈皋桥地铁站西 -- 南砖新村 -- 和燕路·青城路 -- 晓庄 -- 南京卫校 -- 晓庄村 -- 幕府东路 -- 水吉路南 -- 幕府创新小镇

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