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53路[上行]： 农贸中心 -- 白云亭 -- 白云亭西 -- 惠民路 -- 惠民桥 -- 南京西站 -- 机务段 -- 水关桥西 -- 水关桥 -- 大庙村 -- 翠亭路 -- 戎军路南 -- 金域中央总站 -- 幕府新村 -- 五塘村东 -- 旭日景城 -- 黄方村 -- 窑上村 -- 幕府东路 -- 晓庄村 -- 南京卫校 -- 晓庄 -- 和燕路·青城路 -- 南砖新村 -- 迈皋桥广场

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Y9路[上行]： 中山码头 -- 天妃宫小学 -- 南京西站 -- 机务段 -- 方家营路·水关桥 -- 方家营 -- 宝塔桥 -- 南堡公园西 -- 金陵六村 -- 燕江路 -- 燕江路东 -- 上元门 -- 上元门地铁站 -- 白云新寓 -- 五塘村 -- 五佰村路 -- 干休所 -- 河路道 -- 安怀村 -- 安怀村东 -- 东井亭 -- 红山站 -- 东井村 -- 和燕路·迈皋桥 -- 省中西医结合医院 -- 十字街 -- 红山森林动物园 -- 红山路·华跃路 -- 曹后村 -- 新庄广场北 -- 龙蟠路·南京站东 -- 南京站·南广场东

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